As primeiras incursões no atual território de Morro do Chapéu datam do início do século XVI. Gabriel Soares de Sousa foi um dos primeiros a explorar a região em busca de minas de ouro.
A Lei provincial n.° 67, de 1 de junho de 1838 criou o distrito, e o Município, com território desmembrado do de Jacobina, foi formado em 7 de maio de 1864 pela de Lei provincial n.° 933, ocorrendo sua instalação a 6 de novembro do ano seguinte
A Lei estadual n.° 751, de 8 de agosto de 1909, elevou a sede do Município à categoria de cidade. Na atual formação administrativa, o município é compreendido pelos seguintes distritos
- Morro do Chapéu (sede);
- Fedegosos;
- Queimada Nova;
- veredinha;
- Grotão;
- Estácio
- Tareco;
- Angelim;
- Icó;
- velame;
- Dias Coelho;
- Riacho Fundo;
- Buracão;
- Malhada de Areia;
- Duas Barras do Morro;
- Lagoa Nova;
- Tamboril;
- Ventura;
- Mira-Serra;
- Beira-do-Rio;
- Flores;
- Rosa-Benta;
- São Rafael;
- Gruta do Brejões;
- Cachoeira Domingos Lopes;
- Ponta D’água;
- Brejões;
- Umburaninha;
- Ouricuri I e II;
- Barra;
- Olhos D´água do Fagundes;
- Monte Azul;
- Jacarezinho;
- Vermelhos;
A comarca de Morro do Chapéu foi criada pela Lei estadual n.º 1.119; de 1915 e desde 19 de junho de 1945 é integrada apenas pelo próprio Município.
Localiza-se a 384 km a noroeste da capital do estado, na zona oriental da Chapada Diamantina e possui altitude média de 1.100 m. Os pontos de maior altitude chegam a 1.350m, sendo, por isso uma das cidades mais frias do estado com temperaturas em torno de 10°C em algumas épocas do ano.
Morro do Chapéu possui um clima tropical de altitude e é classificado na escala climática internacional de Köppen como Cwa. Com temperaturas suaves para a região com baixa latitude, por volta de 18 a 28 °C, no verão. E no inverno, já foi registrada temperatura mínima abaixo de 10 °C, embora ocorram muito raramente. E por apresentar um verão úmido e mais fresco que as cidades do entorno, moderada principalmente pela altitude acima dos 1000m e pelas chuvas de verão que se apresentam torrencialmente ou advindas do oceano. Possuindo invernos relativamente frios e mais secos e verões úmidos com dias quentes e noites mais frescas.
A economia da região é fortemente baseada na agricultura e pecuária de subsistência e no turismo, porém nos últimos anos vem se desenvolvendo na região investimentos em agricultura empresarial, baseada no tomate, morango e uva, inclusive com instalação de vinícolas de vinhos finos de origem francesa.
A região também recebe fortes investimentos na produção de energia eólica, inclusive com investimentos de empresas energéticas estrangeiras.
As principais atrações turísticas do município são 3 unidades de conservação de proteção integral:
- Gruta dos Brejões (situada na APA Gruta dos Brejões – Vereda do Romão Gramacho);
- Cachoeira do Ferro Doido (“Monumento Natural”); e
- Parque Estadual Morro do Chapéu (“Parque”).
O município tem outros pontos turísticos, como a Cachoeira do Agreste e a Cachoeira de Domingos Lopes, com suas trilhas maravilhosas, o Buraco do Possidônio, em cujo interior há árvores nativas como o cedro. Cientistas julgam ter sido um meteoro gigante que caiu e abriu essa cratera (há geógrafos que afirmam tratar-se de uma dolina); o Balneário do Tareco, que tem águas termais e segundo a população são medicinais; o Morrão, morro que deu origem ao nome do município por ter a forma de um chapéu, sendo visto do lado Sul; além de um centro ufológico e a Vila do Ventura.
Nos seus 115 anos a grande comemoração é o titulo de Capital do Vinho da Chapada Diamantina .
